为整合和表达苏州医工所的创新文化价值理念，使全所职工进一步明确本所的发展方向，提高职工的认同与归属感，更好地宣传和展示研究所的精神风貌，苏州医工所委托专业设计公司设计了该所所标。
苏州医工所所标由五个绿色模块与两条蓝色弧形构成。标志中的绿色模块，构成英文字母S，标明本所所在地（苏州），同时代表着本所的主要学科领域，寓意着科技创新无限、发展前景广阔。
标志中的蓝色双弧线，表明苏州医工所为院地共建机构的特征，同时寓意本所科学研究与产业化相互促进、协调发展。
绿色模块与蓝色弧线构成汉字“中”，表明本所为国立科研机构的特征。同时，双弧线为长春光机所所标外环的变形，表示苏州医工所依托长春光机所筹建和管理运行。
整个标志动中蕴静、静中蕴动，表明本所放眼国际前沿、牢筑基础，立足国内需求、服务百姓的发展理念，体现了本所“创新生物医学工程，服务人民健康幸福”的建所宗旨。
标志整体设计稳重大气、寓意丰富、视觉冲击力强。所标于近日正式发布，在以后的工作中，本所将逐步导入VIS（视觉识别系统），并要求全所职工自觉和规范使用。
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