医工结合主要是联合国内医院开展适宜技术与产品开发，推动医院的创新思想和工程技术紧密结合，促进临床需求和技术创新融合发展。重点支持医疗仪器与试剂的研发，分为分为基础类项目与开发类项目。
1）基础类项目主要对已有系统、仪器等进行方法学研究及验证，需要医生为临床试验等提供便利。
2）开发类项目主要是围绕临床需求，以医生的原创想法为牵引，结合已有的技术基础，开发出新的仪器或试剂等，或是将已有仪器设备进行更新升级。
项目的成果形式包括（但不限于）：文章、专利、实验系统、原理样机、试剂、软件等。
专项设立以来，已先后与吉林大学第一医院、复旦大学附属华山医院、复旦大学附属中山医院等20多家医院签订合作协议，共建研发机构、定期交流、联合申请国家项目；建立知识产权体系保护医生权益；建立奖励与股权激励机制等。
